Ja jakoś nie mam problemów z uruchomieniem Xservera z roota i nigdy nie miałem.
EDIT: Źle przeczytałem twój post, nie wiem czemu ale przeczytałem X.org nie uruchamia się na roocie i zdziwił mnie brak możliwości uruchomienia Xservera przez roota, a Tobie chodziło zapewne, że nie powinno się uruchamiać Xservera przez użytkownika root ale tu i tak system uruchamiany jest w LiveCD, więc nic wielkiego się nie stanie. Większość systemów LiveCD i tak uruchamia Xserver z prawami roota.
Pozdrawiam!