Generalnie taki zabieg (przynajmniej z mojego doświadczenia) jest dość ryzykowny. Jeżeli uda Ci się odinstalować sp3 to może się okazać, że przestaną Ci działać (albo działać poprawnie) niektóre programy, które w czasie instalacji wymagały sp3. Poza tym może to doprowadzić do destabilizacji systemu.
Rozwiązanie jakie ja bym wybrał to ponowna instalacja XP, z płytki bez zintegrowanego sp3 (z jakimś sp2). Wtedy zawsze sp3 możesz doinstalować. I masz pewność stabilności systemu, niekoniecznie programy dadzą się niektóre zainstalować np. wymagające FrameWork3.5 (a ten chyba wymaga sp3).
Chociaż nie rozumiem czemu chcesz go odinstalowywać.