Witam,
Chciałabym wyszukać w Wierszu Poleceń wyrazu zaczynającego się na “AARTT” a kończącego na “TAT” (chodzi tu o sekwencję nukleotydów). W jaki sposób skonstruować polecenie find. Domyślam się, że należy użyć <xyz Word position: beginning of word, xyz> Word position: end of word. Tylko jak powinno wyglądać polecenie?
Mam jeszcze jedno pytanie związane z pierwszym. Jeśli znam początek i koniec wyrazu i ilość liter występująca między nimi np. 10. To jak powinno wyglądać polecenie.
Z góry dziękuje za odpowiedź,
Kasia
Na https://ss64.com/nt/findstr.html wszystko jest ładnie pisane (wraz z przykładami).
Czytałam już tą stronkę, niestety nie ma tam przykładu dotyczącego mojego przypadku. Byłabym wdzięczna za pomoc w napisaniu polecenia, które mnie interesuje
Zakładając, że w pliku sekwencje.txt masz w kolejnych wierszach jakieś sekwencje nukleotydów, jak np. poniżej
AARTTAGCCAGGATA
TACGCCAGCGCCGA
AARTTTRAGCCAGATAT
CGCCAGTCGCRCGA
GCAARTTTRAGCCAGATAT
TAARTTTRAGCCAGATATA
to wyszukanie tych wierszy (sekwencji), o jakich napisałaś, uzyskasz takim poleceniem:
FINDSTR /I /R /C:"^AARTT.*TAT$" sekwencje.txt
I wtedy (dla tej przykładowej zawartości) wynikiem będzie jeden wiersz
AARTTTRAGCCAGATAT
No chyba, że Cię nie zrozumiałem i oczekujesz czegoś innego (to wyjaśnij dokładniej).
EDIT: wyjaśnienie tego polecenia:
/I - wielkość liter w wyszukiwanym tekście nie ma znaczenia (jak ma, opuść ten przełącznik)
/R - użycie wyrażenia regularnego (w którym mamy możliwość oznaczenia początku i/lub końca szukanego ciągu oraz użycia dopasowania dowolnych znaków (tu kropka oznacza dowolny znak, a gwiazdka dowolną liczbę jego występowania)
/C oznacza użycie podanego (w cudzysłowach) zdefiniowanego ciągu do poszukiwania
To wszystko jest ładnie opisane w podlinkowanym findstr.