jak zrobić cos takiego, aby instalator usunął pewne pliki z HDD, potem zainstalował w ich miejsce inne, a następnie dodał pewna wartość do rejestru.Próbowałem chyba z trzema kreatorami instalatorów i w żadnym nie znalazłem takiej opcji jak usuwanie plików.
W dokumentacji Windows Installera masz dział “Removing Stranded Files”. Do tworzenia Windows Installera możesz użyć programów z pakietu MSI SDK. Przypuszczam, że każdy inny poważniejszy instalator to potrafi (choćby Nullsoft Installer), jedynie niewystarczająco dokładnie szukałeś.
Polecam InnoSetup. I przeczytanie dokumentacji do niego. Nie takie rzeczy potrafi zrobić 