MPEG-2 możesz edytować (np. usuwać fragmenty) w Avidemux i ponownie zapisać bez rekompresji (MPEG-PS).
Można również skorzystać z MPEG Streamclip - wymagany jest jednak QuickTime Pro lub starsza wersja QuickTime Alternative.
Jeszcze inną opcją jest Movica (dzielenie, łączenie, wycinanie).
VirtualDub (+odpowiedni plugin) oraz VirtualDub-MPEG2 mogą otworzyć MPEG-2, ale nie mogą zapisać MPEG-2 bez rekompresji lub dekompresji w AVI (a wcale nie mają możliwości zapisu do MPEG).
W tym przypadku zapisałeś po prostu wideo w nieskompresowanej formie i stąd taka wielkość.