Z resztą możliwe, że przy łączeniu trochę bitrate siada w celu znormalizowania różnic między plikami nie znam szczegółów bo program szukałem na szybko.
No dobra, chyba się wszystko udało. Film się przerobił, jakość została bez zmian, rozmiar się nie zmienił, ząbków nie ma, więc wszystko super. Przy okazji okazało się, że ten tsMuxer wcale nie jest potrzebny do łączenia plików - na innej stronie znalazłem poradę, że można to zrobić w wierszu poleceń:
copy /B plik.mts + plik.mts1 + plik.mts2 wynik.mts
Nie dość, że trwa to dosłownie parę sekund, to bitrate i wszystko inne pozostaje bez zmian. Dzięki za pomoc, będę nagrywał z telewizji, bo jak widać różnice w jakości są bardzo duże.