Co do AC3 Filter to widzę że masz ustawione Output format na AS IS, ten tryb jest dobry jeśli ktoś ma zestaw głośników 5.1 ale kiepsko się sprawdza gdy ma się tylko głośniki stereo bo przy filmach z audio 5.1 dźwięki przeznaczone na np. tylne głośniki giną bo nie są przekierowywane (efekt zwykle jest taki że efekty specjalne są głośne a głosy aktorów ciche).
Jeśli nie masz głośników 5.1 to zalecam ustawienie w AC3 Filter Output format na 2/0 - Stereo.
W ALLPlayerze kodek ten jest ustawiony jako nadrzędny i jest używany przy wszystkich plikach, w WMP to chyba zależy od tego jaki priorytet mu ustawi jego instalator, QuickTime o ile mi wiadomo używa tylko i wyłącznie swojego jednego kodeka i nie korzysta AC3 Filter ani innych zainstalowanych w systemie wcale (nie wiem jakie są priorytety kodeków w Windows Media Player Classic i MPLayer).
Nie wiem czy to dobry trop bo “zniekształcenie dźwięku” jak to określiłeś jest nieprecyzyjnym stwierdzeniem, może spróbuj dokładniej opisać co masz na myśli.
Ale wydaje mi się że to może przyczyna twoich problemów.
Co do mp4 to szkoda że nie napisałeś jaki kodek zainstalowałeś żeby ci WMP odtwarzał a sam WMP też nie ma żadnej funkcji która by pozwalała sprawdzić jakich kodeków używa przy odtwarzaniu (wspomniany ALLPlayer ma funkcję która pokazuje filtry w użyciu więc łatwiej diagnozować problemy z odtwarzaniem).
Ogólnie sprawa kodeków nie jest taka prosta więc nie napiszę ci jaki kodek powinieneś zainstalować aby poszły ci filmy z rozszerzeniem mp4 bo nie da się tego jednoznacznie napisać.
Na plik składa się format kontenerowy (zwykle odpowiada on rozszerzeniu pliku np. .mp4 .avi itp.) ale w środku taki plik składa się z kilku elementów (zazwyczaj 2: 1 ścieżka audio + 1 ścieżka video) więc aby było możliwe odtworzenie danego pliku odtwarzacz musi dobrać do niego odpowiednią kombinację splittera, dekodera audio i dekodera video.
Sprawa jest o tyle złożona że formatów kodowania video i formatów kodowania audio jest naprawdę sporo a formaty kontenerowe AVi oraz MP4 dopuszczają bardzo szeroką listę możliwych kodowań audio i video.
Jeśli ktoś jest kumaty to w przypadku gdy nie może odtworzyć jakiegoś pliku najlepiej żeby sprawdził jakie kodowanie audio i video jest w nim użyte (np. programem MediaInfo) i odszukał w sieci dekodera dla tego formatu.
A jeśli ktoś nie zna się lub nie czuje się na siłach kombinować z kodekami (bo można sobie zrobić spory bałagan w kodekach) to zostaje mu korzystanie z paczek kodeków (codecpacków), tylko błagam nie instalujcie lekkich paczek bazujących główne na FFDShow (daje on marną jakość a potrafi mocno obciążać system).