Przy dodawaniu każdego nowego (kolejnego) konta do programu odznacz "Używaj globalnej skrzynki odbiorczej … "; potem już w menu "Edycja -> Konfiguracja kont - dla każdego konta z osobna ustawisz sobie gdzie ma zapisywać wysłane, odebrane itd poprzez wskazanie folderu “Odebrane konta Lokalne Foldery” lub "Odebrane konta *@.pl ".
Jak zrobić, aby klient był w tle i jak tylko przyjdzie wiadomość to pojawiał soę jakiś komunikat w stylu masz nową wiadomość. Ew. w przeglądarce nich by pokazywał.
W Thunderbirdzie dodatki czy rozszerzenia dodajemy tak samo jak w Firefoxie “Narzędzia -> Dodatki”, zainstaluj sobie dodatek “Moztraybiff” lub “New Mail Icon”, potem ewentualnie ustawiasz jakieś preferencje w tym samym miejscu.