polecam
ULEAD GIF ANIMATOR
links na PW poszedł 
Photo Filtre, za pomocą wtyczki Animated GIF import, wszystko na stronie http://www.photofiltre.com/
Jeśli twoje tło jest jednolitego koloru to najprościej mozesz to zrobić w programie Animation Shop 3
Przeciągasz do programu gifa z animacją następnie zaznaczasz wszystkie klatki Ctrl+A
Następnie wciskasz Shift + Alt +Enter i ustawiasz klatki na [Transparent].
Potem już tylko musisz wybrać sobie narzędzie [Flood Fill] ustawić odpowiednią Tolerancję i zaznaczasz [To Canvas Color no] i usuwasz tło 
